
Nüfuzu ilə tanınan Ş.Xanbabayev Şəmsəddin Xanbabayev icra başçısı vəzifəsindən azad edildikdən sonra, Yeni Azərbaycan Partiyasının Xaçmaz rayonun təşkilatına sədr təyin olunmuşdu.
O, Sovet dövründən Naxçıvanda müxtəlif yüksək vəzifələrdə çalışıb.
1990–1992-ci illərdə Naxçıvan MR Dövlət Plan Komitəsinin sədri, Naxçıvan MR baş nazirinin müavini, 1992-ci ildən Naxçıvan Muxtar Respublikasının baş naziri, 2000–2004-cü illərdə isə Azərbaycan Respublikası Əmək və Əhalinin Sosial Müdafiəsi nazirinin müavini vəzifələrində çalışıb.
Azərbaycan Respublikası Prezidentinin 23 oktyabr 2004-cü il tarixli Sərəncamı ilə Xaçmaz Rayon İcra Hakimiyyətinin başçısı vəzifəsinə təyin edilib.
30 mart 2009-cu ildə Azərbaycan Respublikasının Prezidenti İlham Əliyevin sərəncamı ilə "Şöhrət" ordeni, 4 aprel 2014-cü il tarixli sərəncamı ilə "Şərəf" ordeni, 28 mart 2019-cu il tarixli sərəncamı ilə "1-ci dərəcəli əmək" ordeni ilə təltif olunub.
Ölkə.Az-ın məlumatına görə, onun oğlu polkovnik Samir Xanbabayev hazırda polis orqanında rəis vəzifəsində çalışır.
Mərhum 1939-cu il aprelin 1-də Naxçıvan MR-nın Ordubad rayonunun Aşağı Əndəmic kəndində anadan olmuşdu.
Xaçmaz şəhərində vəfat edən Ş.Xanbabayev Bakıda dəfn olunacaq.